足利義満は、1391年の 明徳の乱 で「六分一殿」と呼ばれた 山名氏清 を滅ぼしました。
応永の乱では、四国・北九州を滅ぼした 大内義弘 を滅ぼしています。
なお、応永の乱の時、義満は既に将軍職を退いていましたが、権力は持ち続けていました。

嘉吉の乱の後、将軍の代替わりに際して、「代始めの徳政令」を要求した 嘉吉の土一揆 が起こりました。
これを受けて、室町幕府として初めての徳政令が出されました。

応仁の乱の後、山城国で争い続けた畠山氏を1485年に追放した国人一揆を 山城の国一揆 と呼びます。
加賀で、一向宗（浄土真宗）の信徒たちが守護 富樫政親 を自殺に追い込んだ一揆は 加賀の一向一揆 です。
加賀では、その後100年にわたる自治が行われました。