「勉強していませんでした」と言うときの表現だね。
「～していました」ならwas[were]＋動詞のing形。
今回は否定文だから、 be動詞wasのあとにnotを置く 。
これがポイントだったね。

主語はKen and Yutaで複数形だね。
Ken and Yuta were playing soccer.なら「健と優太はサッカーをしていました。」だね。
今回は 否定文だから、be動詞wereのあとにnotを置こう。

(3)は「読んでいましたか」という疑問文をつくろう。
「読んでいました」ならwas[were]＋動詞のing形。
今回は 疑問文だから、be動詞を前に出せばいい ね。
主語はYumiなのでwasを使おう。

(3)に対して「はい」と答えよう。
be動詞の過去形wasで聞かれているから、wasで答えよう。

(3)に対して「いいえ」と答えよう。
be動詞の過去形で聞かれているから、be動詞の過去形で答えよう。
短縮形を使ってbe動詞のあとにnotを入れるよ。

(6)は「何を」という質問だね。
「何を」の疑問文はwhatで切り出そう。
whatのあとに、「していましたか」という疑問文を続ければいいね。
「する」はdoで表せるよ。